1938年5月20日，法国莫拉纳·索尼埃公司研制的MS.406战斗机迎来了它的首次飞行。这款战斗机采用了下单翼的传统布局，其机身主体几乎由铝合金制成，而后机身则以帆布作为装饰和保护层。此外，该机还配备了可以收起和放下的起落架，便于在不同环境中起飞和降落。MS.406装备了一台由西班牙与瑞士合作生产的12Y31型活塞发动机，这款发动机拥有900马力的强劲动力，使得战斗机在5000米的高空时能够达到时速486公里，最远航程能够覆盖1000公里。

在武器装备方面，MS.406战斗机配备了一门20毫米的机头机关炮以及两个机翼各装有一挺7.5毫米机枪。这款飞机是法国空军首架时速突破400公里的战斗机，因而军方对该机的性能感到非常满意。为了应对笼罩在欧洲上空的战争威胁，法国空军开始下达大规模生产MS.406战斗机的命令。由于莫拉纳·索尼埃公司的生产能力有限，军方决定在国内设立三座新的制造厂，很快就投入了大量的生产。首架MS.406战斗机于1939年1月29日顺利下线，到了四月份，其日产量已达到六架之多。

1939年9月3日，法国正式向纳粹德国宣战，此时已生产出535架MS.406战斗机，日产量提升至11架。在1939年11月至1940年初，MS.406还开始向芬兰出口30架，接着在2月到3月间又向土耳其出口30架。然而，到1940年3月，由于法德关系紧张，MS.406的生产被迫中止，最终该机的总产量达到了1064架。

1939年5月10日，德国军队开始对法国发起大规模进攻，标志着法国战役的爆发。强大的德国空军对法国境内的各类目标进行无情轰炸，尽管法国空军的飞行员勇敢应战，共计击落了175架德军飞机，但法军却遭受了更为惨重的损失。在空战中，法军共损失了约100架MS.406战斗机，另外还有300余架在地面被德军飞机摧毁。此外，因德军地面部队逼近，约150架停在机场的MS.406战斗机不得不被自己的军队炸毁，以免落入敌手。尽管如此，德国军方在法国投降后仍然缴获了约450架MS.406，这些飞机中有部分被纳入维希法国傀儡政府的空军服役，还有一些被送往海外的殖民地部队使用。其中69架MS.406更换了机翼和散热器，专门用于训练德军飞行员。

德军还将一些MS.406战斗机转交给了附庸国的军队，例如芬兰接收了57架，克罗地亚获得了44架，而意大利则得到了55架。芬兰空军为了优化其装备，于1943年采用德国在苏德战争中缴获的苏制飞机螺旋桨推进器及1100马力的克里莫夫M-105P发动机对自家的MS.406进行了改装。此外，他们还更换了新的油冷却器和MG151机炮，改装后的飞机被命名为Mrk型战斗机。这种经过改装的MS.406在性能上有了较显著的提升，成功参与了芬兰空军与德军及苏联空军之间的战斗。

在各国使用的MS.406战斗机中，除了因战斗损失被摧毁的，其余由于缺乏零配件和维护，基本上在二战结束时被迫退役，最终走向了废弃的命运。